Spike2 sous Windows version 5

Le logiciel de laboratoire Spike2 assure une saisie et une analyse de données, un séquencement de stimulus et un contrôle expérimental puissants utilisant l'une des familles CED de périphériques d'acquisition de données. Spécialement développé pour la recherche en sciences de la vie, Spike2 est déjà utilisé dans des milliers de laboratoires à travers le monde pour une vaste gamme d'applications. La Version 5 est la toute dernière version de ce progiciel polyvalent.

Spike2 enregistre un ensemble de formes d'onde, événements, marqueurs numériques, notes, marqueurs clavier et pointes triées. Le nombre total de canaux dépend de votre configuration matérielle 1401. L'échantillonnage peut être continu, minuté ou péri-déclenché.

L'analyse des formes d'onde inclut le moyennage, les spectres de puissance, la discrimination de formes d'onde et les mesures de surface, pente et amplitude efficace. Les fonctions d'analyse d'événement incluent l'INTH, le PSTH, l'analyse des trames et les corrélations d'événements. Ces fonctionnalités d'analyse sont disponibles en ligne comme hors ligne.

L'interface interactive Spike2 facile à utiliser assure la saisie de données, l'analyse de données et le contrôle d'affichage complets que de nombreux utilisateurs exigent. Les tâches répétitives, les analyses personnalisées et la gestion d'expériences complexes peuvent être automatisées grâce au langage de script incorporé.

Caractéristiques du Spike2

Fréquences d'échantillonnage indépendantes pour les canaux de forme d'onde afin d'optimiser le stockage et l'analyse des données.
Saisie sur disque directe continue, minutée ou péri-déclenchée de données de formes d'onde et de marqueurs d'événements.
Marqueurs de texte et numériques pour l'annotation et l'indication d'événements externes et pour faciliter la révision et l'analyse sélectives.
Analyse multi-canal en ligne et hors ligne des données de forme d'onde et d'évènement avec barres et trames d'erreur type sur la moyenne ou l'écart type.
Analyse multi-canal de formes d'onde et de données d'événement en ligne et hors ligne, avec barres et trames pour l'écart type et l'erreur type de la moyenne.
Détection et mesure de caractéristiques de formes d'onde automatiques.
Possibilité d'importer un large éventail de fichier de données tiers.
Automatisation et personnalisation des analyses et des tâches répétitives.
Filtrage numérique , lissage de courbe et transfert de données entre fichiers.
Affichage « trigger-hold » (maintien de déclenchement) pour les vues de réponse de type oscilloscope.
Mesures tracées en vues XY ou sauvegardées dans des canaux de fichiers de données, ceci en ligne comme hors ligne.
Puissant séquenceur de sortie pour la génération de stimuli tels que pulsations, rampes et formes d'onde pendant l'échantillonnage
Enregistrement d'électrode, stéréotrode et tétrode avec tri des pointes au moyen de gabarits et de regroupements en grappes, sur la base des composantes principales ou de mesures spécifiées. Les grappes peuvent être triées automatiquement ou à l'aide d'ellipses définies par l'utilisateur.

Acquisition de données (réclame une interface CED)

Enregistrement continu ou effectué à des moments programmés dans le temps ou déclenchés
Echantillonnage de formes d'onde avec différentes fréquences d'échantillonnage sur chaque canal.
Enregistrement de jusqu'à 8 canaux d'événements à une résolution très élevée ; les sources les plus courantes incluent les pulsations de synchronisation ou la sortie à partir d'un discriminateur de formes d'onde.
Classification d'activité de transitoires à unités multiples en unités individuelles sur plusieurs canaux
Génération de pulsations et de formes d'onde arbitraires pour le séquencement des stimuli et le contrôle des conditions expérimentales.
Visualisation des formes d'onde arbitraires préenregistrées au cours de la saisie des données.
Configuration d'amplificateurs à programmation dynamique tels que le CED 1902.
Changement rapide de configuration expérimentale par simple clic de souris.
Automatisation de génération de noms de fichiers et sauvegarde d'une séquence de fichiers
Calibrage facile de canaux de formes d'onde avec feed-back des résultats vers la configuration d'échantillonnage
Accès aux données reçues en temps réel pour des réponses très rapides liées aux changements des niveaux de formes d'onde et de détection d'événements
Synchronisation d'unités multiples Power 1401 et Micro1401 mk 2 pour échantillonner de nombreux canaux sans dérapage temporel entre ces derniers

Contrôle expérimental et séquencement de stimuli
Spike2 peut prendre en charge des protocoles complexes de contrôle expérimental et de séquencement de stimuli pendant la capture de données grâce au séquenceur de sortie. Le séquenceur contrôle jusqu'à 16 sorties TTL et 8 sorties analogiques avec une résolution temporelle précise.

Les sorties de séquenceur incluent : impulsions carrées, ondes sinusoïdales, ondes rampées et formes d'onde préenregistrées ou générées par l'utilisateur. L'accès au séquenceur en ligne pour les formes d'onde et données d'événement entrantes permet une réactivité aux changements exceptionnelle.

Le langage de script offre d'autres options telles que la communication par lignes série ou les commandes de lancement et d'interruption d'autres programmes.

Tri et liaison en grappe de pointes pour plus de détails
Spike2 crée automatiquement des gabarits à partir des données de pointe brutes en fonction de paramètres définis par l'utilisateur. Tous les événements de pointe individuels dépassant des seuils prédéfinis sont capturés et classés en fonction du meilleur appariement (best match). Les gabarits peuvent être fixes ou suivre les changements de la forme de pointe dans le temps Vous pouvez également créer des gabarits sur la base du regroupement en grappes ou en faisant glisser une pointe particulière vers un gabarit.

Jusqu'à 8 gabarits peuvent être utilisés par canal en ligne, ceci pour un maximum de 32 canaux. Vous pouvez suivre et modifier les gabarits pendant l'acquisition de données. Hors ligne, un nombre bien plus important de gabarits est disponible par canal.

Spike2 peut regrouper les données de pointe en grappes en appliquant une analyse en composantes principales ou en fonction de mesures de forme d'onde de pointe définies par l'utilisateur. Les grappes peuvent être formées automatiquement ou manuellement en découpant les grappes à l'aide d'ellipses. La rotation tridimensionnelle des grappes et la relecture d'activité permettent une meilleure visualisation des formations en grappe. Les fonctionnalités interactives incluent les INTH pour les grappes en cours, le suivi des grappes dans le temps et la sélection de pointes individuelles par clic de souris sur un dialogue de grappe.

Langage de script
Spike2 est un puissant progiciel possédant les fonctions clé en main réclamées par la plupart des utilisateurs. Il peut être encore amélioré par l'utilisation de scripts.

Les fonctions du langage script comprennent:

Commandes de haut niveau pour l'exécution d'analyses complexes avec une instruction simple
Barres d'outils, fenêtres de menu et boîtes de dialogues programmables pour personnaliser les interfaces d'utilisateur
Structures de commande familière (pour...boucles, procédures suivantes, etc.)
Outils de débogage incluant points d'arrêt, fonctionnement en pas à pas simple et accès aux valeurs variables
Éditeur de texte de script avec liste de fonction déroulante, coloriage syntaxique et options de fenêtres divisées
Aide liée au contexte

Alors que de nombreux utilisateurs rédigent leurs propres scripts, CED fournit un service de rédaction de script et continue de développer et de gérer une bibliothèque de scripts. Ceux-ci sont mis à la disposition des clients et fournissent une vaste gamme de fonction sur mesure incluant l'analyse de transitoire complexe et le contrôle de stimuli multiples avec l'analyse associée. D'autres scripts rédigés par CED et le client sont disponibles sur le site web de CED.

Pour vous introduire à la rédaction des scripts, le progiciel Spike2 inclut des exemples de scripts à utiliser comme modèles, des scripts qui génèrent automatiquement un code pour les barres d'outils et les dialogues, un manuel de référence de script exhaustif et un manuel de formation avec des travaux pratiques couvrant une vaste gamme de sujets de rédaction de scripts. Vous pouvez également rédiger des scripts par exemple ! Pour ce faire, activez l'enregistrement de scripts, exécutez les actions à enregistrer et désactivez l'enregistrement de scripts. Spike2 va ouvrir une nouvelle fenêtre renfermant les équivalents de commande de script de vos actions.

Analyse de transitoires Discrimination en ligne et hors ligne avec intercorrélations, analyse de PSTH, d'INTH et affichage de cadences d'amorçage, détection et analyse des activités par rafales, moyennage déclenché par transitoires et essais de collision.

Potentiels d'action Les curseurs actifs localisent les temps de démarrage, les crêtes, les creux, la pente maximale, les temps de pourcentage de repolarisation, les points d'inflexion, etc. en ligne et hors ligne avec enregistrement automatique des mesures et des valeurs vers le texte et les visualisations XY.

Potentiels évoqués Moyennage de base et conditionnel avec contrôle des stimuli, détection de composante de potentiel évoqué et mesure avec manipulation de forme d'onde incluant le lissage, la différenciation et le filtrage.

EMG Calcul et affichage des changements des niveaux EMG dans le temps en utilisant les FFT ou la zone sous la courbe, calcul de la vélocité de la conduction des fibres musculaires et traçage de l'amplitude et de la force d'EMG.

Cardiovasculaire Détection et mesure des caractéristiques de forme d'onde, ex: complexe QRS, intervalles Q-T, valeurs systoliques et diastoliques en utilisant les curseurs actifs, analyse de variabilité du rythme cardiaque, intervalles R-R, cycle d'attaque et études Langdorff.

EEG (électroencéphalogramme) Analyse spectrale à bande en ligne et hors ligne utilisant les scripts, la génération automatique de résultats mesurés à partir des procédés FFT intégré dans le format textuel et graphique.

Recherche en matière de perception visuelle Enregistrement synchronisé de la position de l'œil et de l'activité neurale avec contrôle des stimuli, affichage de la position de l'œil calcul du temps sur la cible, analyse conditionnelle basée sur des marqueurs codés.

Études du sommeil Enregistrement à long terme simultané de signaux multiples incluant l'EEG, l'ECG (électrocardiogramme), l'EMG, la respiration, la température et le son échantillonnés à des fréquences indépendantes, analyse en ligne et hors ligne incluant l'analyse de Fourier des signaux d'EEG et d'EMG.

Études du comportement Enregistrement de l'activité animale avec essais et marqueurs de stimuli, contrôle des conditions expérimentales et distribution de récompenses via les sorties du séquenceur RS232 et 1401.

Formation Travaux pratiques d'étudiants d'exécution de scripts personnalisés rédigés conformément aux spécifications exactes fournies par les professeurs. Les exigences incluent l'utilisation de fichiers d'aide avec des instructions d'expérience et la comparaison des résultats mesurés par l'ordinateur avec ceux de l'étudiant.

Caractéristiques de la nouvelle version 5
Échantillonnage

Possibilité d'échantillonner un nombre bien plus important de canaux avec des 1401 synchronisés.
Enregistrement par tétrode et stéréotrode.
Echantillonnage péri-déclenché avec jusqu'à quatre groupes de canaux.
Fenêtre de suivi d'activité de pointe multi-canal.
Enregistrement multimédia son et vidéo, verrouillé dans le temps en fonction des données Spike2.
Sécurité des données améliorée en cas d'arrêt du système.
Automatic measurement of waveform features

Analyse pour plus de détails

Analyse en composantes principales des formes de pointe avec visualisation tridimensionnelle des grappes.
Regroupement en grappes de formes de pointe sur la base de l'amplitude, du temps, des surfaces et des pentes.
Dialogues de curseur étendus de façon à inclure les intervalles de curseur en tant que fréquence, erreur moyenne quadratique, écart moyen et type d'une étendue x et les mesures effectuées à partir de marqueurs réels et d'événements tracés en tant que fréquences.
Tracé automatique de marqueurs et de mesures dans des canaux de fichier de données en ligne et hors ligne.
Canaux « virtuels » générés par des expressions définies par l'utilisateur. Ils peuvent être utilisés pour l'analyse de formes d'onde, l'arithmétique inter-canal et la conversion de données d'événement et de marqueur en formes d'onde.
Nouvelle option de sortie texte avec re-échantillonnage et interpolation pour une exportation simple vers des progiciels d'éditique.
Lissage interactif de polynomiaux, exponentiels, sinusoïdes, gaussiennes et courbes sigmoïdes sur des données en vues temporelle, résultat et XY.

Contrôle

Les dialogues de script étendus sont équipés de boutons programmables et peuvent réagir aux changements d'utilisateur alors que les processus de script d'arrière-plan se poursuivent.
Modes de tracé TextMark pour affichage de texte dans la visualisation horaire. Les marqueurs possèdent un "état" coloré optionnel pour le marquage conditionnel.
Mode de tracé de spline cubique dans les visualisations de résultats.
Contrôle de script sur les dialogues de modélisation de pointe.

D'autres optimisations du Spike2 version 5 seront mises à la disposition des utilisateurs inscrits, gratuitement en tant que téléchargements à partir de notre site web.

Spike2 version 5 réclame un CED Power1401, Micro1401 ou 1401plus une interface de laboratoire intelligente et un PC avec Windows 95, 98, Me, Windows NT 4, 2000 ou XP. Nous recommandons que le PC possède une RAM de 256Mo minimum.