Spike2 classe les formes d'onde par rapport à des gabarits d'onde complète, ceci sur un ou plusieurs canaux et que cela soit en ligne ou hors ligne. Spike2 permet la capture et l'analyse de données obtenues par électrode unique, stéréotrode et tétrode. Pour compléter l'appariement de gabarit, le logiciel inclut également les analyses de grappes en utilisant l'analyse en composantes principales et les mesures directes de caractéristiques de forme d'onde.
Principales fonctionnalités
Tri de pointes en ligne et hors ligne.
Tri de 8 types de pointe par canal sur 32 canaux en ligne (et plus hors ligne).
Enregistrements à électrode unique, stéréotrode et tétrode.
Méthodes de tri multiples.
Fonctions d'analyse en ligne.
Synchronisation de systèmes multiples pour l'enregistrement de grands nombres de canaux.
Affichage des classes de pointe triées d'un canal en canaux séparés.
Méthodes de tri Appariement de gabarit
Génération de gabarit automatique ou manuelle.
Paramètres de qualité du lissage définis par l'utilisateur.
Comparaison, fusion et suppression de gabarits.
Les gabarits peuvent être fixes ou suivre les changements de la forme de pointe dans le temps.
Modification des gabarits en ligne.
Les gabarits sauvegardés peuvent être chargés en vue d'une utilisation avec d'autres canaux et fichiers.
Regroupements en grappes
Outre l'appariement de gabarits, les pointes peuvent également être triées par « découpage des grappes » (cluster cutting). Les valeurs calculées par ACP ou les mesures définies par l'utilisateur sont tracées dans une fenêtre de grappe 3D.
Fenêtre de grappe
Des rotations tridimensionnelles peuvent être pratiquées sur la vue à l'aide de la souris ou des curseurs de défilement.
Algorithmes de moyenne K et de mélange normal pour la séparation automatique des grappes.
Séparation manuelle des grappes par placement d'ellipses.
Visualisation des points d'un pourcentage de l'ensemble de la plage temporelle et avancée pas à pas dans le temps pour suivre les grappes mobiles.
Génération d'histogrammes d'intervalles basés sur les grappes affichées.
Possibilité de montrer/cacher des grappes particulières.
Identification visuelle des pointes mises en grappe au sein d’une période réfractaire spécifiée.
Option de tracé de densité pour aider à l’identification des grappes.
Copie des valeurs en texte (valeurs des données sous-jacentes et affichage des coordonnées).
Sélection des pointes individuelles d'un clic de souris pour la classification manuelle.
Sélection des composantes principales pour tracer sur les axes X, Y et Z.
Calcul des composantes pour les canaux à traces multiples (stéréotrode ou tétrode) basé sur la forme d'onde complète, l'amplitude de crête ou le ratio des amplitudes de crête sur les amplitudes moyennes.
Mesures définies par l'utilisateur
Sélection des mesures pour les axes X, Y et Z pour regrouper les données en grappes.
Mesure des temps, amplitudes, pentes et surfaces.
Possibilité de sauvegarder jusqu'à 10 configurations contenant des ensembles de mesures différents.
Pour les données à traces multiples, mesure de la trace individuelle ou moyenne des mesures de trace.
Génération de grappes basée sur des mesures définies par l'utilisateur
Fonctions d'analyse de pointe
Les fonctions intégrées d'analyse de données de pointe incluent :
PSTHs
Corrélations mutuelles
Histogrammes d'intervalles
Affichage des fréquences
Fréquences moyennes et instantanées
Moyennage déclenché par des pointes
Histogrammes de phases
Vous pouvez appliquer ces fonctions d'analyse en ligne et hors ligne, effectuer des analyses complémentaires avec le langage de script ou exporter les données vers un autre logiciel, par exemple Matlab.
Suivi des pointes
La fenêtre redimensionnable de suivi des pointes affiche l'activité des pointes dans une grille, avec une cellule de grille par canal.
Possibilité d'afficher jusqu'aux 40 dernières pointes se trouvant dans un intervalle de temps défini par l'utilisateur.
Etude de l'activité des pointes à partir du temps d'échantillonnage en cours ou à tout moment au sein du fichier de données.
Ouverture du dialogue d'édition de gabarit pour un canal d'un clic de souris.
Sélection du mode d'affichage :
3D avec éloignement des pointes dans le temps
2D avec « surtraçage » de toutes les pointes
2D, la dernière pointe étant présentée séparément des autres pointes surtracées
Possibilité d'afficher ou de cacher les duplicata des principaux canaux de pointe.
Matériel CED
Lorsqu'il est utilisé avec les interfaces CED 1401, Spike2 vous permet de capturer des données continues de forme d'onde, d'événement et de marqueur tout en triant les pointes en temps réel et en générant les stimuli de sortie.
Les flèches joignant des points représentent des pointes mises en grappes au sein d’une période réfractaire spécifiée
Histogrammes d'intervalles établis à partir des grappes de pointes en cours
Dialogue de configuration de gabarit
Modes de tracé de données de pointe
Identification visuelle des pointes mises en grappe
Génération de grappes basée sur des mesures définies par l'utilisateur
Histogrammes d'intervalles établis à partir des grappes de pointes en cours
Suivi de pointe multi-canal
