Spike2 Spitzensortierung

Spitzensortierung

Spike2 klassifiziert Wellenformen anhand von Ganzwellen-Vorlagen auf einem oder mehreren Kanälen, sowohl online als auch offline. Die Software umfasst Einzelelektroden-, Stereotroden- und Tetroden-Aufzeichnung und -Analyse. Zur Ergänzung der Vorlagen-Zuordnung bietet die Software Clustering mittels Hauptkomponentenanalyse und direkten Wellenform-Feature-Messwerten.

Hauptmerkmale

Online- und Offline-Spitzensortierung
Sortierung von 8 Spitzenarten pro Kanal auf 32 Kanälen online (mehr offline)
Einzelelektroden-, Stereotroden- und Tetroden-Aufzeichnung
Mehrere Sortiermethoden
Online-Analysefunktionen
Synchronisieren mehrerer Systeme zur Aufzeichnung sehr vieler Kanäle
Anzeige sortierter Spitzenklassen von einem Kanal als getrennte Kanäle

Sortiermethoden
Vorlagen-Zuordnung

Automatische oder manuelle Erstellung von Vorlagen
Benutzerdefinierte Parameter zur Einstellung der Passungsgüte
Vergleichen, Verbinden und Löschen von Vorlagen
Fixieren von Vorlagen, oder Verfolgen von Veränderungen der Spitzenform über einen Zeitraum
Modifizieren von Vorlagen online
Laden gespeicherter Vorlagen zur Verwendung mit verschiedenen Kanälen und Dateien

Clustering
Als Alternative zur Vorlagen-Zuordnung lassen sich Spitzen auch durch Clustering sortieren. Per Hauptkomponentenanalyse ermittelte Werte oder benutzerdefinierte Messwerte werden dafür in einem 3D-Clustering-Fenster abgebildet.

Cluster-Fenster

3D-Rotation von Ansichten mithilfe von Maus oder Schiebereglern
K-Means- und Normal-Mixtures-Algorithmus für automatische Clustertrennung
Manuelle Clustertrennung durch Schneiden mit Ellipsen
Anzeige von Punkten aus einem prozentualen Anteil der gesamten Zeitspanne und Abspielen des Verlaufs, um sich bewegende Cluster zu verfolgen
Erstellen von Intervall-Histogrammen anhand angezeigter Cluster
Ein-/Ausblenden bestimmter Cluster
Visuelle Identifizierung geclusterter Spitzen innerhalb einer vorgegebenen Refraktärzeit
Option für Dichte-Plot zur leichteren Identifizierung von Clustern
Kopieren von Werten als Text (zugrunde liegende Datenwerte und Anzeigekoordinaten)
Auswahl individueller Spitzen per Mausklick zur manuellen Klassifizierung

Hauptkomponentenanalyse

Auswahl von Hauptkomponenten zum Einordnen auf X-, Y- und Z-Achsen
Berechnung von Komponenten für Multi-Trace-Kanäle (Stereotroden oder Tetroden) basieren auf ganzer Wellenform, Spitzenamplitude oder Verhältnis von Spitzen- zu mittlerer Amplitude.

Benutzerdefinierte Messwerte

Auswahl von Messwerten für X-, Y- und Z-Achsen zum Clustern der Date
Messung von Zeiten, Amplituden, Steilheiten und Flächen
Speichern von bis zu 10 Konfigurationen mit unterschiedlichen Messwertgruppen
Bei Multi-Trace-Daten: Messung einer individuellen Trace oder Durchschnittsbildung von Trace-Messwerten

Funktionen für die Spitzenanalyse
Integrierte Analysefunktionen für Spitzendaten sind u.a.:

PSTH
Kreuzkorrelationen
Intervall-Histogramme
Anzeige von Auslöseraten
Mittlere und Momentanfrequenzen
Von Spitzen ausgelöste Mittelwertbildung
Phasen-Histogramme

Sie können diese Analysefunktionen online und offline ausführen, mithilfe der Scriptsprache weitere Analysen vornehmen oder die Daten in andere Software (z.B. Matlab) importieren.

Spitzenmonitor
Das größenverstellbare Spitzenmonitor-Fenster zeigt die Spitzenaktivität in einem Raster an (eine Rasterzelle pro Kanal).

Anzeige bis zu den letzten 40 Spitzen in einem benutzerdefinierten Zeitraum
Prüfung der Spitzenaktivität von der aktuellen Abtastzeit oder zu einem beliebigen Zeitpunkt in der Datendatei
Aufrufen des Vorlagen-Bearbeitungsdialogs für einen Kanal per Mausklick
Auswahl des Anzeigemodus:
- 3D mit Fortbewegung der Spitzen im Zeitverlauf
- 2D mit allen Spitzen überzeichnet
- 2D mit letzter Spitze getrennt von den überzeichneten Spitzen
Ein- oder Ausblenden von Duplikaten der Hauptspitzenkanäle

CED hardware
Bei Verwendung mit CED-Schnittstellen 1401 lassen sich mit Spike2 kontinuierliche Wellenformen, Ereignis- und Markerdaten aufzeichnen, gleichzeitig Spitzen in Echtzeit sortieren und Ausgabe-Stimuli erzeugen.